Proteomikos centras

Dviejų pakopų praskriejimo laiko (TOF/TOF) masių spektrometras 4800 MALDI TOF/TOF, Applied Biosystems, netiesiogiai sujungtas su skysčio nano-chromatografu Ultimate 3000, Dionex, ir MALDI plokštelių paruošėju   Sistema tiksliam bei kiekybiniam baltymų ir peptidų identifikavimui bei kontrolei proteomikos ir biomarkerių tyrimuose. Atliekamas tikslus baltymo masės nustatymas, palaikomas “in-gel” skaidymas ir skystinės chromatografijos MALDI srautas, jonų optinė sistema turi tiesinę, atspindžio detekciją bei tikro prekursoriaus pasirinktą MS/MS. Kietakūnis Nd:YAG 200 Hz lazeris, automatinė bandinio plokštės (MTP formato) pakrovimo sistema, video sistema bandinio lygiavimui. Vidutiniškai atliekama 500 MS/MS spektrų/min. GPS Explorer programinė įranga.
Hibridinis masių spektrometras sudarytas iš jonų gaudyklės ir masių analizatorius  Q TRAP 4000 LC/MS/MS System, Applied Biosystems, tiesiogiai sujungtas su skysčio nano-chromatografu   Sistema skirta įvairių junginių, metabolitų nustatymui ir charakterizavimui, proteominei analizei, baltymų cheminės modifikacijos nustatymui, biožymenų aptikimui. Jonų šaltiniai: elektrinio purškimo jonų (TurbolonSpray), APCI ir nanopurškimo (NanoSpray), srauto greitis 2 nl/min - 2000 nl/min. Masių spektrometras: jonų gaudyklė, skaldymo kiuvetė, jonų kvadrupolis, kurie sudaro linijinį trigubą kvadrupulį ir linijinę jonų gaudyklę, atmosferos-vakuumo sąsaja, vakuumo sistema, detektorius. Masių diapazonas 5-2800 m/z kvadrupoliniame režime, 50 -2800 m/z jonų gaudyklės režime. Skenavimo greitis jonų gaudyklės režime pasirenkamas nuo 250 amu/sec iki 4000 amu/sec.
Nanosrautų skystinė chromatografinė sistema Ultimate 3000, Dionex   Skystinė chromatografija baltymų ir peptidų skyrimui ir analizei. Dvigubo gradientinio strauto didelio tikslumo siurblys: palaiko du srautus – nano ir mikro. Srauto greitis nuo 50 nL/min iki 2.5 mL/min. Nanosrauto formavimo sistema: elektroninis srauto dalytuvas, temperatūros palaikymas 5-70 oC Automatinė pavyzdžių įvedimo sistema: įvedimo tūris – 20 nL-100 mL.
Dionex Ultimate™ 3000 chromatografijos sistema ir Probot™ mėginio užnešimui ant MALDI plokštelių
Ettan ™ IPGphor 3 sistema izofokusavimui
Gelių skaneris Image Scanner™ III
SDS-PAG elektroforezės sistema Ettan DALTsix™
LI-COR® Odyssey infraraudonų spindulių skeneris
Hoefer SE600 horizontalios elektroforezės sistema